Theo đó, qua công tác kiểm tra, Đoàn Thanh tra tỉnh phát hiện Bệnh viện Y học cổ truyền Quảng Nam có nhiều sai phạm và hạn chế. Đặc biệt, ông Ngô Ngọc Toàn, Giám đốc bệnh viện chỉ đạo chi tiền hàng tháng (7/2020 đến 2/2021) để ông đứng tên giấy phép hành nghề cho bệnh viện với số tiền 5 triệu đồng/tháng. Theo Quy định tại Điểm 43 Luật khám bệnh, chữa bệnh năm 2009, ông Ngô Ngọc Toàn là Giám đốc bệnh viện được Sở Y tế phân công quản lý và chịu trách nhiệm cao nhất về chuyên môn tại bệnh viện. Do đó, việc chi trả cho bác sỹ Ngô Ngọc Toàn với nội dung đứng tên chịu trách nhiệm chuyên môn theo Giấy phép hoạt động của bệnh viện là không đúng quy định và vi phạm vào các hành vi bị cấm của Luật Khám bệnh, chữa bệnh.
Đồng thời, từ cuối năm 2022, số tiền tạm ứng của một số cá nhân tại bệnh viện quá niên độ kế toán vẫn chưa thanh toán tạm ứng hơn 308 triệu đồng. Trong đó có những cá nhân tạm ứng từ năm 2020 đến 2022 với số tiền phát sinh lớn (hơn 234 triệu đồng) nhưng chứng từ kế toán không rõ nội dung tạm ứng và quá niên độ nhưng không thực hiện thủ tục hoàn ứng. Theo giải trình của bệnh viện, các khoản tạm ứng này chủ yếu diễn ra trong giai đoạn dịch COVID-19, được sử dụng cho việc mua sắm phục vụ phòng, chống dịch nên việc hoàn thiện các chứng từ để hoàn ứng gặp nhiều khó khăn, dẫn đến kéo dài đến nay chưa thu hồi. Tuy nhiên, qua làm việc với các cá nhân tạm ứng cho thấy, việc tạm ứng được Giám đốc và Kế toán trưởng bệnh viện phê duyệt nhưng không có nội dung thực hiện và chưa hoàn trả số tiền đã tạm ứng. Do đó, Giám đốc và Kế toán trưởng bệnh viện đã thiếu trách nhiệm trong việc duyệt chi tạm ứng và kiểm tra, đôn đốc thu hồi các khoản tạm ứng của cá nhân.
Kết quả thanh tra cũng chỉ ra việc bệnh viện ký hợp đồng lao động với bác sĩ Trần Nhung (từ ngày 23/3/2020 đến 4/1/2021) ngoài giờ hành chính để thực hiện công tác khám chữa bệnh tại bệnh viện trong giờ hành chính là không hợp lệ (bởi, trong khi đó, bác sĩ Trần Nhung đăng ký hành nghề khám chữa bệnh toàn thời gian (cơ hữu) tại Bệnh viên đa khoa Thăng Hoa tại huyện Thăng Bình, Quảng Nam). Bên cạnh đó, hợp đồng giữa bệnh viện và bác sĩ Trần Nhung không nêu rõ nội dung công việc ngoài giờ hành chính mà bác sĩ này phải thực hiện để làm cơ sở đánh giá, nghiệm thu, chi trả thanh toán hợp đồng giữa 2 bên; việc tổ chức thực hiện bệnh viện nhưng vẫn chưa thực hiện.
Ngoài ra, qua thanh tra còn phát hiện nhiều tồn tại, bất cập khác tại bệnh viện này. Những nội dung sai phạm và thực hiện chưa đúng quy định Nhà nước với tổng số tiền hơn 673 triệu đồng.
Trên cơ sở đó, Chánh thanh tra tỉnh Nguyễn Đức Tiến kiến nghị Chủ tịch UBND tỉnh chỉ đạo Sở Nội vụ, Sở Y tế, Sở Tài chính kịp thời có phương án củng cố tổ chức bộ máy Ban giám đốc Bệnh viện Y học cổ truyền Quảng Nam; đồng thời rà soát điều chỉnh phương án tự chủ tài chính của bệnh viện phù hợp với tình hình thực tế nhằm tạo nguồn thu nhập và ổn định công tác cho đội ngũ y, bác sĩ, viên chức, người lao động tại bệnh viện. Bệnh viện Y học cổ truyền Quảng Nam tiến hành kiểm điểm bác sĩ Ngô Ngọc Toàn - Giám đốc bệnh viện và các cá nhân sai phạm. Sở Y tế xem xét xử lý trách nhiệm người đứng đầu Bệnh viện Y học cổ truyền Quảng Nam về những tồn tại, hạn chế trong công tác quản lý, sử dụng tài chính như nội dung kết luận đã nêu…